Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico
Descripción del Articulo
Caracteriza a nivel molecular el mhAb1142 contra el virus del dengue 2 (DENV-2) haciendo uso de herramientas bioinformáticas. Primero, se describe la estructura primaria del mhAb11421 usando ExPASyProtparam. Segundo, se predijo las regiones determinantes de complementariedad (CDRs) del mhAb11421 med...
| Autor: | |
|---|---|
| Formato: | tesis de grado |
| Fecha de Publicación: | 2024 |
| Institución: | Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| Repositorio: | UNMSM-Tesis |
| Lenguaje: | español |
| OAI Identifier: | oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/25032 |
| Enlace del recurso: | https://hdl.handle.net/20.500.12672/25032 |
| Nivel de acceso: | acceso abierto |
| Materia: | Dengue Antivirales Bioinformática Virología https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.04.00 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.02 |
| id |
UNMS_0dee19830478cfd96f3d72a785748b00 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/25032 |
| network_acronym_str |
UNMS |
| network_name_str |
UNMSM-Tesis |
| repository_id_str |
410 |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico |
| title |
Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico |
| spellingShingle |
Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico Ojanama Cruz, Brenda Dengue Antivirales Bioinformática Virología https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.04.00 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.02 |
| title_short |
Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico |
| title_full |
Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico |
| title_fullStr |
Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico |
| title_full_unstemmed |
Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico |
| title_sort |
Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico |
| author |
Ojanama Cruz, Brenda |
| author_facet |
Ojanama Cruz, Brenda |
| author_role |
author |
| dc.contributor.advisor.fl_str_mv |
Mayta Huatuco, Egma Marcelina |
| dc.contributor.author.fl_str_mv |
Ojanama Cruz, Brenda |
| dc.subject.none.fl_str_mv |
Dengue Antivirales Bioinformática Virología |
| topic |
Dengue Antivirales Bioinformática Virología https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.04.00 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.02 |
| dc.subject.ocde.none.fl_str_mv |
https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.04.00 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03 https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.02 |
| description |
Caracteriza a nivel molecular el mhAb1142 contra el virus del dengue 2 (DENV-2) haciendo uso de herramientas bioinformáticas. Primero, se describe la estructura primaria del mhAb11421 usando ExPASyProtparam. Segundo, se predijo las regiones determinantes de complementariedad (CDRs) del mhAb11421 mediante los postulados de Kabat, Chothia e IMGT. Tercero, se modela el mhAb11421 empleando los servidores Alphafold2, Swiss model, Rosie y Phyre2 y estos se validaron con Procheck, Errat y Verify3D. Por último, se realizó el acoplamiento molecular entre el mhAb11421 y sE DENV-2 (PDB 1OKE) con Cluspro y Alphafold2multímero. Los resultados de la caracterización in silico del mhAb11421 contribuyó al análisis de su estructura primaria, identificación de su estructura terciaria, determinación de CDRs GFNLYSY (CDR-H1), SPSSGY (CDR-H2), YYWSSFALDY (CDR-H3), RASQSVSSAVA (CDR-L1), SASSLYS (CDR-L2), QQSYAYYSALFT (CDR-L3) (según Chothia) y al reconocimiento de la cresta lateral del dominio II del sE DENV-2 como región de interacción del anticuerpo. Esta caracterización del mhAb11421 permite proyectar su uso como potencial inmunoterapéutico contra el DENV-2. |
| publishDate |
2024 |
| dc.date.accessioned.none.fl_str_mv |
2025-01-24T21:09:16Z |
| dc.date.available.none.fl_str_mv |
2025-01-24T21:09:16Z |
| dc.date.issued.fl_str_mv |
2024 |
| dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
| format |
bachelorThesis |
| dc.identifier.citation.none.fl_str_mv |
Ojanama, B. (2024). Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico. [Tesis de pregrado, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Escuela Profesional de Genética y Biotecnología]. Repositorio institucional Cybertesis UNMSM. |
| dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://hdl.handle.net/20.500.12672/25032 |
| identifier_str_mv |
Ojanama, B. (2024). Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico. [Tesis de pregrado, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Escuela Profesional de Genética y Biotecnología]. Repositorio institucional Cybertesis UNMSM. |
| url |
https://hdl.handle.net/20.500.12672/25032 |
| dc.language.iso.none.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.relation.ispartof.fl_str_mv |
SUNEDU |
| dc.rights.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| dc.rights.uri.none.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/pe/ |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/pe/ |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| dc.publisher.country.none.fl_str_mv |
PE |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:UNMSM-Tesis instname:Universidad Nacional Mayor de San Marcos instacron:UNMSM |
| instname_str |
Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| instacron_str |
UNMSM |
| institution |
UNMSM |
| reponame_str |
UNMSM-Tesis |
| collection |
UNMSM-Tesis |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/a4549484-660a-4825-9de8-c8a8b8fa5aed/download https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/e2b46bb1-f58f-4921-a021-d0e128f89fc9/download https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/145fb8c2-e48c-4ced-b445-ba3a3dd47d3b/download https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/e59b4490-0e9e-42c9-94cc-a9429ac65972/download https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/cf7b2a3f-f243-45bb-8349-224ec12ff091/download https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/57f2309d-5064-4037-9ae2-a4e20971bb91/download https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/fa89d4d0-ea51-444a-840b-4c6e9ece1886/download https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/4eab4bbb-118c-401f-b8c7-5de234dde2df/download https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/80717175-9591-463f-924c-a732b9970078/download https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/b55f4ff8-abae-42f9-94ad-5d2c92a93a87/download https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/7d4fac0b-2c27-4c83-bf55-14bf8b655d7d/download |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
425ab27307b4a83e054f900fa449d558 088bb15b4327ed8fd27633e535653df5 71ed2c3bd3313460ddc2262fe1130951 1f14487299a8a795dc379bc1df9968a0 bb9bdc0b3349e4284e09149f943790b4 8107a9e02160f7763135119770ea7f6d 1a5a20221ae90fd878b9d2f855fb816a 031113b1cba0b6baf50d8a2896e13a1d cdadb561cd2b471f94220613b8469dac 1893a56dce4724baddc496648fbd9439 28423b503a2794e49184faeb5a031ea8 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Cybertesis UNMSM |
| repository.mail.fl_str_mv |
cybertesis@unmsm.edu.pe |
| _version_ |
1868179356176613376 |
| spelling |
Mayta Huatuco, Egma MarcelinaOjanama Cruz, Brenda2025-01-24T21:09:16Z2025-01-24T21:09:16Z2024Ojanama, B. (2024). Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéutico. [Tesis de pregrado, Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Ciencias Biológicas, Escuela Profesional de Genética y Biotecnología]. Repositorio institucional Cybertesis UNMSM.https://hdl.handle.net/20.500.12672/25032Caracteriza a nivel molecular el mhAb1142 contra el virus del dengue 2 (DENV-2) haciendo uso de herramientas bioinformáticas. Primero, se describe la estructura primaria del mhAb11421 usando ExPASyProtparam. Segundo, se predijo las regiones determinantes de complementariedad (CDRs) del mhAb11421 mediante los postulados de Kabat, Chothia e IMGT. Tercero, se modela el mhAb11421 empleando los servidores Alphafold2, Swiss model, Rosie y Phyre2 y estos se validaron con Procheck, Errat y Verify3D. Por último, se realizó el acoplamiento molecular entre el mhAb11421 y sE DENV-2 (PDB 1OKE) con Cluspro y Alphafold2multímero. Los resultados de la caracterización in silico del mhAb11421 contribuyó al análisis de su estructura primaria, identificación de su estructura terciaria, determinación de CDRs GFNLYSY (CDR-H1), SPSSGY (CDR-H2), YYWSSFALDY (CDR-H3), RASQSVSSAVA (CDR-L1), SASSLYS (CDR-L2), QQSYAYYSALFT (CDR-L3) (según Chothia) y al reconocimiento de la cresta lateral del dominio II del sE DENV-2 como región de interacción del anticuerpo. Esta caracterización del mhAb11421 permite proyectar su uso como potencial inmunoterapéutico contra el DENV-2.Perú. Programa Nacional de Investigación Científica y Estudios Avanzados (PROCIENCIA) Contrato N° 354-2019-FONDECyT.application/pdfspaUniversidad Nacional Mayor de San MarcosPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/pe/DengueAntiviralesBioinformáticaVirologíahttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.04.00https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.02Caracterización in silico del anticuerpo monoclonal humano mhAb11421 neutralizante del virus Dengue 2 con potencial uso inmunoterapéuticoinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisreponame:UNMSM-Tesisinstname:Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstacron:UNMSMSUNEDUBióloga Genetista BiotecnólogaUniversidad Nacional Mayor de San Marcos. Facultad de Ciencias Biológicas. Escuela Profesional de Genética y BiotecnologíaGenética y Biotecnología06175080https://orcid.org/0000-0001-8471-167574841932919036Ramirez Malaver, Jorge LuisRodríguez Quispe, Edith FaninciaColona Vallejos, Erasmo Honoriohttps://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesionalhttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesisORIGINALC295_2024_Ojanama_cb_AUTORIZACION.pdfC295_2024_Ojanama_cb_AUTORIZACION.pdfapplication/pdf122430https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/a4549484-660a-4825-9de8-c8a8b8fa5aed/download425ab27307b4a83e054f900fa449d558MD57C295_2024_Ojanama_cb_REPORTE.pdfC295_2024_Ojanama_cb_REPORTE.pdfapplication/pdf12107071https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/e2b46bb1-f58f-4921-a021-d0e128f89fc9/download088bb15b4327ed8fd27633e535653df5MD58Ojanama_cb.pdfOjanama_cb.pdfapplication/pdf4888527https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/145fb8c2-e48c-4ced-b445-ba3a3dd47d3b/download71ed2c3bd3313460ddc2262fe1130951MD59CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8905https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/e59b4490-0e9e-42c9-94cc-a9429ac65972/download1f14487299a8a795dc379bc1df9968a0MD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/cf7b2a3f-f243-45bb-8349-224ec12ff091/downloadbb9bdc0b3349e4284e09149f943790b4MD55TEXTC295_2024_Ojanama_cb_AUTORIZACION.pdf.txtC295_2024_Ojanama_cb_AUTORIZACION.pdf.txtExtracted texttext/plain3937https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/57f2309d-5064-4037-9ae2-a4e20971bb91/download8107a9e02160f7763135119770ea7f6dMD510C295_2024_Ojanama_cb_REPORTE.pdf.txtC295_2024_Ojanama_cb_REPORTE.pdf.txtExtracted texttext/plain2289https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/fa89d4d0-ea51-444a-840b-4c6e9ece1886/download1a5a20221ae90fd878b9d2f855fb816aMD512Ojanama_cb.pdf.txtOjanama_cb.pdf.txtExtracted texttext/plain105787https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/4eab4bbb-118c-401f-b8c7-5de234dde2df/download031113b1cba0b6baf50d8a2896e13a1dMD514THUMBNAILC295_2024_Ojanama_cb_AUTORIZACION.pdf.jpgC295_2024_Ojanama_cb_AUTORIZACION.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg20613https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/80717175-9591-463f-924c-a732b9970078/downloadcdadb561cd2b471f94220613b8469dacMD511C295_2024_Ojanama_cb_REPORTE.pdf.jpgC295_2024_Ojanama_cb_REPORTE.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg17690https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/b55f4ff8-abae-42f9-94ad-5d2c92a93a87/download1893a56dce4724baddc496648fbd9439MD513Ojanama_cb.pdf.jpgOjanama_cb.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg15356https://cybertesis.unmsm.edu.pe/bitstreams/7d4fac0b-2c27-4c83-bf55-14bf8b655d7d/download28423b503a2794e49184faeb5a031ea8MD51520.500.12672/25032oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/250322025-01-26 03:12:18.566http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/pe/info:eu-repo/semantics/openAccessrestrictedhttps://cybertesis.unmsm.edu.peCybertesis UNMSMcybertesis@unmsm.edu.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 |
| score |
12.824051 |
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).