Eficacia del diagnóstico molecular SARS CoV-2 por inactivación a calor en saliva e hisopado cornete frente extracción hisopado nasofaringeo Iquitos 2021

Descripción del Articulo

The purpose of this project was to establish a real-time PCR assay for the detection of SARS-CoV-2 that would use a non-invasive biological sample such as saliva or mid-turbinate swab that would provide results in a short period of time and that would support SARS CoV-2 diagnostic procedures in Iqui...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores: Shapiama López, Wagner Valentino, Paredes Olórtegui, Maribel
Formato: tesis de maestría
Fecha de Publicación:2023
Institución:Universidad Nacional De La Amazonía Peruana
Repositorio:UNAPIquitos-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.unapiquitos.edu.pe:20.500.12737/9844
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12737/9844
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Patología molecular
Técnicas de diagnóstico molecular
Prueba de laboratorio
Valor predictivo de las pruebas
Infecciones por coronavirus
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description The purpose of this project was to establish a real-time PCR assay for the detection of SARS-CoV-2 that would use a non-invasive biological sample such as saliva or mid-turbinate swab that would provide results in a short period of time and that would support SARS CoV-2 diagnostic procedures in Iquitos city. This project aimed to compare the internal effectiveness positivity, sensitivity, specificity, and positive predictive value of a molecular diagnostic test for SARS-CoV-2 using extracted RNA from saliva and mid-turbinate swabs versus heat extraction of the same biological samples. This is a cross-sectional, prospective, analytical study. A total of 289 participants were enrolled after they requested a real-time PCR test to detect SARS CoV-2 at the reference laboratory of the Regional Government of Loreto. The Centers for Disease Control of the United States validated primers and probes. The difference between the sensitivity, specificity, and positive predictive value of the real-time PCR test using extracted RNA and heat-inactivated biological samples were not statistically significantly different, p-value> 0,05, proving that both assays were effective.
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spelling Silva Delgado, Hermann FedericoShapiama López, Wagner ValentinoParedes Olórtegui, Maribel2024-02-23T13:38:39Z2024-02-23T13:38:39Z2023616.200475 S47 2023https://hdl.handle.net/20.500.12737/9844The purpose of this project was to establish a real-time PCR assay for the detection of SARS-CoV-2 that would use a non-invasive biological sample such as saliva or mid-turbinate swab that would provide results in a short period of time and that would support SARS CoV-2 diagnostic procedures in Iquitos city. This project aimed to compare the internal effectiveness positivity, sensitivity, specificity, and positive predictive value of a molecular diagnostic test for SARS-CoV-2 using extracted RNA from saliva and mid-turbinate swabs versus heat extraction of the same biological samples. This is a cross-sectional, prospective, analytical study. A total of 289 participants were enrolled after they requested a real-time PCR test to detect SARS CoV-2 at the reference laboratory of the Regional Government of Loreto. The Centers for Disease Control of the United States validated primers and probes. The difference between the sensitivity, specificity, and positive predictive value of the real-time PCR test using extracted RNA and heat-inactivated biological samples were not statistically significantly different, p-value> 0,05, proving that both assays were effective.Los motivos que han llevado a la ejecución de este proyecto fueron establecer una prueba molecular de RT-PCR para SARS CoV-2, con resultados en corto tiempo y con toma de muestra biológica no invasiva a través de la saliva e hisopado de cornete medio, brindando soporte al diagnóstico oportuno del SARS CoV-2 en la ciudad de Iquitos. Como parte de los objetivos planteados se buscó comparar la eficacia del diagnóstico molecular para SARS CoV-2 por inactivación a calor en saliva e hisopado de cornete medio, frente a la extracción de ARN mediante kit en muestras de hisopado nasofaríngeo, mediante el cálculo de su positividad, sensibilidad, especificidad y valor predictivo positivo (VPP). Este estudio corresponde al tipo trasversal – prospectivo, de diseño analítico no experimental, cuya población de muestra fueron 289 participantes que acudieron a realizarse una prueba molecular en las instalaciones del Laboratorio referencial Regional de Salud Loreto en la ciudad de Iquitos. Para el diagnóstico de PCR se utilizaron los primers 2019-nCoV_N1, 2019-nCoV_N2 y RP. La positividad, sensibilidad, especificidad, y valor predictivo positivo (VPP) resultaron similares a la prueba Gold estándar extracción con kit en muestras de hisopado nasofaríngeo, con pvalor > 0,05, demostrando que las pruebas evaluadas fueron eficaces.application/pdfspaUniversidad Nacional de la Amazonía PeruanaPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/Patología molecularTécnicas de diagnóstico molecularPrueba de laboratorioValor predictivo de las pruebasInfecciones por coronavirushttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.03https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.09Eficacia del diagnóstico molecular SARS CoV-2 por inactivación a calor en saliva e hisopado cornete frente extracción hisopado nasofaringeo Iquitos 2021info:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:UNAPIquitos-Institucionalinstname:Universidad Nacional De La Amazonía Peruanainstacron:UNAPIquitosSUNEDUMaestría en Salud PúblicaUniversidad Nacional de la Amazonía Peruana. Escuela de PostgradoMaestro(a) en Salud Pública7280727405371019https://orcid.org/0000-0002-3875-571105360639https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesis021047https://purl.org/pe-repo/renati/level#maestroRamal Asayag, Cesar JohnnyFreitas Caycho, Rosa MercedesCastro Gómez, Juan CarlosORIGINALWagner_TrabajoDeInvestigación_Maestría_2023.pdfWagner_TrabajoDeInvestigación_Maestría_2023.pdfTexto completoapplication/pdf2021435https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/c028f27e-0290-41be-990f-88eb5e5e4510/downloade86d07fbba455cfded0f8db19e5b0c82MD51trueAnonymousREADWagner_Formulario de Autorizacion.pdfWagner_Formulario de Autorizacion.pdfapplication/pdf1053990https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/2b569f67-6697-42a6-9cdf-7c1014b0da35/download1ef191808d4893978d246a0fe617231cMD52falseAdministratorREADWagner_Constancia de Similitud.pdfWagner_Constancia de Similitud.pdfapplication/pdf791969https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/7ce0c1f5-3fd4-4bc7-b6d4-6e28b66bc334/downloadaa5141fe139aba1f7610cdef104e7fb6MD53falseAdministratorREADWagner_Constancia de Conformidad.pdfWagner_Constancia de Conformidad.pdfapplication/pdf374509https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/8063d547-9b7f-4efe-99c3-993cf971182b/download3c4d303ab2dbd9cc758c1a24e712ea58MD54falseAdministratorREADTEXTWagner_TrabajoDeInvestigación_Maestría_2023.pdf.txtWagner_TrabajoDeInvestigación_Maestría_2023.pdf.txtExtracted texttext/plain65918https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/7504b767-94ef-45f0-bc9e-0c66c89ac235/download595a7b50458a4250977665e28b3f6743MD590falseAnonymousREADWagner_Formulario de Autorizacion.pdf.txtWagner_Formulario de Autorizacion.pdf.txtExtracted texttext/plain4476https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/b7703a25-f60f-4419-ae4c-8dd6fd3cb9fc/downloadf7dc159db22111f2a815124af8f40feeMD592falseAdministratorREADWagner_Constancia de Similitud.pdf.txtWagner_Constancia de Similitud.pdf.txtExtracted texttext/plain46669https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/870f81d5-9b6a-44e7-b32b-3789095e80a7/download16b041475c9c89667c753cc701de84b3MD594falseAdministratorREADWagner_Constancia de Conformidad.pdf.txtWagner_Constancia de Conformidad.pdf.txtExtracted texttext/plain1441https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/1c8268bd-75e3-47fa-a26e-85fff729853a/download4d53864901aad90a63aa5fe7e5b8be7dMD596falseAdministratorREADTHUMBNAILWagner_TrabajoDeInvestigación_Maestría_2023.pdf.jpgWagner_TrabajoDeInvestigación_Maestría_2023.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3909https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/12bbea56-30f6-45ee-a96f-ba65bf767a83/downloaded0126e8f42813939b45fc9cacda12edMD591falseAnonymousREADWagner_Formulario de Autorizacion.pdf.jpgWagner_Formulario de Autorizacion.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3717https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/cb90a0ca-4221-48c8-9818-3e95952f2f10/download769d668c02addf44c858a55e7138b298MD593falseAdministratorREADWagner_Constancia de Similitud.pdf.jpgWagner_Constancia de Similitud.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3960https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/065cdf67-c205-4164-81ba-380d18a0c8cc/download40d7bddf13654908b81ba1a40bc5a400MD595falseAdministratorREADWagner_Constancia de Conformidad.pdf.jpgWagner_Constancia de Conformidad.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4710https://repositorio.unapiquitos.edu.pe/bitstreams/f66e8068-0b99-4c96-a11d-055378cbed08/download708c91849ee7e89dc33e96577b2f613cMD597falseAdministratorREAD20.500.12737/9844oai:repositorio.unapiquitos.edu.pe:20.500.12737/98442025-09-27T19:16:47.284217Zhttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://repositorio.unapiquitos.edu.peRepositorio Digital UNAPrepositorio.institucional@unapiquitos.edu.pe
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