Análisis de los niveles de expresión de los genes iaaH y C-prot de Agrobacterium spp. encontrados en el genoma de Ipomaea batatas L. "Camote" (cv. Jewel)

Descripción del Articulo

Universidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de Ciencias. Departamento Académico de Biología
Detalles Bibliográficos
Autor: Lértora Briceño, Bruno
Formato: tesis de grado
Fecha de Publicación:2018
Institución:Universidad Nacional Agraria La Molina
Repositorio:UNALM-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/3248
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12996/3248
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Ipomaea batatas
Genoma
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Biotecnología vegetal
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Con este objetivo, se cuantificó mediante RT-qPCR en tiempo real la expresión de los genes iaaH (Indol-3-Acetoamida Hidrolasa) y C-prot (C-protein) encontrados en I. batatas L. “camote” (cultivar Jewel) provenientes del T-DNA de Agrobacterium spp. Las expresiones relativas fueron analizadas en cuatro tejidos: ápice, hojas, raíces y raíces tuberosas durante el desarrollo de la planta (divididos en periodos del uno al ocho, con intervalos de tomas de muestra cada 15 días). Se observó que el gen iaaH tuvo una sobreexpresión con respecto al control en los tejidos de raíz y raíz reservante, en el tejido de hoja hubo mucha variación en la expresión y, en el tejido apical, una menor expresión durante toda la etapa de desarrollo. En el caso del gen C-prot, hubo una sobreexpresión con respecto al control en el tejido de hoja durante el crecimiento de la planta, en el tejido apical hubo un aumento de expresión durante el último mes de observación, mientras que en los tejidos de raíz y raíz reservante hubo una menor expresión durante toda la etapa de desarrollo de la plantaSweet potato (Ipomoea batatas Lam) currently ranks as the seventh most important crop in the world with more than 106 million tons in annual production. Agrobacterium is a genus of bacteria that can infect and cause the formation of tumors in a wide variety of plants, including sweet potato. These infections are mediated by plasmids that carry a DNA fragment called transfer DNA or “T-DNA”. Sequences of the Agrobacterium T-DNA have been found naturally integrated into the genome of untransformed sweet potato cultivars (Kyndt et al., 2015) and it’s interesting to do an analysis of the expressions of the genes found. With this objective, the expression of the iaaH (Indole-3-Acetoamide Hydrolase) and C-prot (Cprotein) genes found in Ipomoea batatas L. “camote” (Jewel cultivar) from the T-DNA of Agrobacterium spp. was quantified by real-time RT-qPCR. The relative expressions were analyzed in four tissues: apical shoot, leaves, roots and storage roots during plant development (divided into time points one to eight, each consisting of 15 days intervals). It was observed that the iaaH gene had an up-regulation in comparison with the control in the root and storage root tissues, the leaf tissue contained many variations in the expression while the apical tissue had a lower expression during the entire development stage. In the case of the C-prot gene, there was an up-regulation in comparison with the control in the leaf tissue during the growth of the plant, and in the apical tissue there was an increase in expression during the last month of observation, whereas the roots and storage root tissues had less expression during the entire stage of plant developmentTesisapplication/pdfspaUniversidad Nacional Agraria La MolinaPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Ipomaea batatasGenomaAgrobacteriumGenesDesarrollo biológicoCrecimientoBiotecnología vegetalFitomejoramientoEvaluaciónPerúCamoteNiveles de expresiónGenes iaaHGenes C-protCv. Jewelhttp://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07Análisis de los niveles de expresión de los genes iaaH y C-prot de Agrobacterium spp. encontrados en el genoma de Ipomaea batatas L. "Camote" (cv. Jewel)info:eu-repo/semantics/bachelorThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionreponame:UNALM-Institucionalinstname:Universidad Nacional Agraria La Molinainstacron:UNALMSUNEDUBiologíaUniversidad Nacional Agraria La Molina. Facultad de CienciasBiólogo42618542https://orcid.org/0000-0002-5369-087221124314https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesishttps://purl.org/pe-repo/renati/level#tituloProfesional511206López Bonilla, César FernandoBlas Sevillano, Raúl HumbertoOgata Gutiérrez, KattyTHUMBNAILlertora-briceño-bruno.pdf.jpglertora-briceño-bruno.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3469https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/768e10bd-11f9-4aa7-aea8-e3a2164be162/download4f3e6580c0bcb56e41a08590cd2f3886MD55F30-L4-T-resumen.pdf.jpgF30-L4-T-resumen.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3578https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/7bb7ff70-aae9-4085-b99d-4d7245f7ac54/downloadf6f5e3a2f95176d282c738b9186626c0MD57ORIGINALlertora-briceño-bruno.pdflertora-briceño-bruno.pdfTexto completoapplication/pdf2079222https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/30f7ca02-3649-4cd7-ad59-7d3ac5b975b6/downloade54b6033818d2436211a902a49b74ffdMD51F30-L4-T-resumen.pdfF30-L4-T-resumen.pdfResumenapplication/pdf303016https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/ec6bda3d-6ff7-4ff0-ad81-5e02c7df2437/downloadbb2ef4673e5d97e80de260b525825b4dMD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81683https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/d8e9b363-233c-4ac4-a3f2-d7f9b588ff55/download85e652b8dfa19b82485c505314e0a902MD52TEXTlertora-briceño-bruno.pdf.txtlertora-briceño-bruno.pdf.txtExtracted texttext/plain160687https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/7cf57bc3-d61a-4445-a50a-0eb09c2d93b0/download03511c5b125d5227fdae871504af949aMD53F30-L4-T-resumen.pdf.txtF30-L4-T-resumen.pdf.txtExtracted texttext/plain4351https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/769a44af-f078-4648-b90b-e1867dd568cb/downloadd7e8a74da21137b656decebf271fb6efMD5620.500.12996/3248oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/32482025-03-13 17:07:44.776https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://repositorio.lamolina.edu.peRepositorio Universidad Nacional Agraria La Molinadspace@lamolina.edu.peTGljZW5jaWEgZGUgVXNvCiAKTGEgVW5pdmVyc2lkYWQgTmFjaW9uYWwgQWdyYXJpYSBMYSBNb2xpbmEgKFVOQUxNKSwgZGlmdW5kZSBtZWRpYW50ZSBzdSAKcmVwb3NpdG9yaW8gbG9zIHRyYWJham9zIGRlIGludmVzdGlnYWNpw7NuIHByb2R1Y2lkb3MgcG9yIGxvcyBtaWVtYnJvcyBkZSBsYSAKdW5pdmVyc2lkYWQuIEVsIGNvbnRlbmlkbyBkZSBsb3MgZG9jdW1lbnRvcyBkaWdpdGFsZXMgZXMgZGUgYWNjZXNvIGFiaWVydG8gCnBhcmEgdG9kYSBwZXJzb25hIGludGVyZXNhZGEuCgpTZSBhY2VwdGEgbGEgZGlmdXNpw7NuIHDDumJsaWNhIGRlIGxhIG9icmEsIHN1IGNvcGlhIHkgZGlzdHJpYnVjacOzbi4gUGFyYSBlc3RvIAplcyBuZWNlc2FyaW8gcXVlIHNlIGN1bXBsYSBjb24gbGFzIHNpZ3VpZW50ZXMgY29uZGljaW9uZXM6CgpFbCBuZWNlc2FyaW8gcmVjb25vY2ltaWVudG8gZGUgbGEgYXV0b3LDrWEgZGUgbGEgb2JyYSwgaWRlbnRpZmljYW5kbyBvcG9ydHVuYSB5CmNvcnJlY3RhbWVudGUgYSBsYSBwZXJzb25hIHF1ZSBwb3NlYSBsb3MgZGVyZWNob3MgZGUgYXV0b3IuCgpObyBlc3TDoSBwZXJtaXRpZG8gZWwgdXNvIGluZGViaWRvIGRlbCB0cmFiYWpvIGRlIGludmVzdGlnYWNpw7NuIGNvbiBmaW5lcyBkZSAKbHVjcm8gbyBjdWFscXVpZXIgdGlwbyBkZSBhY3RpdmlkYWQgcXVlIHByb2R1emNhIGdhbmFuY2lhcyBhIGxhcyBwZXJzb25hcyBxdWUgCmxvIGRpZnVuZGVuIHNpbiBlbCBjb25zZW50aW1pZW50byBkZWwgYXV0b3IgKGF1dG9yIGxlZ2FsKS4KCkxvcyB0cmFiYWpvcyBxdWUgc2UgcHJvZHV6Y2FuLCBhIHBhcnRpciBkZSBsYSBvYnJhLCBkZWJlbiBwb3NlZXIgbGEgY2l0YWNpw7NuIApwZXJ0aW5lbnRlIHRhbCBjb21vIGxvIGluZGljYW4gbGFzIE5vcm1hcyBUw6ljbmljYXMgZGVsIElJQ0EgeSBDQVRJRSBkZSAKUmVkYWNjacOzbiBkZSBSZWZlcmVuY2lhcyBCaWJsaW9ncsOhZmljYXMuIENhc28gY29udHJhcmlvLCBzZSBpbmN1cnJpcsOhIGVuIGxhIApmaWd1cmEganVyw61kaWNhIGRlbCBwbGFnaW8uCgpMb3MgZGVyZWNob3MgbW9yYWxlcyBkZWwgYXV0b3Igbm8gc29uIGFmZWN0YWRvcyBwb3IgbGEgcHJlc2VudGUgbGljZW5jaWEgZGUgdXNvLgoKRGVyZWNob3MgZGUgYXV0b3IKCkxhIFVOQUxNIG5vIHBvc2VlIGxvcyBkZXJlY2hvcyBkZSBwcm9waWVkYWQgaW50ZWxlY3R1YWwuIExvcyBkZXJlY2hvcyBkZSBhdXRvciAKc2UgZW5jdWVudHJhbiBwcm90ZWdpZG9zIHBvciBsYSBsZWdpc2xhY2nDs24gcGVydWFuYTogTGV5IHNvYnJlIGVsIERlcmVjaG8gZGUgCkF1dG9yIHByb211bGdhZG8gZW4gMTk5NiAoRC5MLiBOwrA4MjIpLCBMZXkgcXVlIG1vZGlmaWNhIGxvcyBhcnTDrWN1bG9zIDE4OMKwIHkgCjE4OcKwIGRlbCBkZWNyZXRvIGxlZ2lzbGF0aXZvIE7CsDgyMiwgTGV5IHNvYnJlIGRlcmVjaG9zIGRlIGF1dG9yIHByb211bGdhZG8gZW4gCjIwMDUgKExleSBOwrAyODUxNyksIERlY3JldG8gTGVnaXNsYXRpdm8gcXVlIGFwcnVlYmEgbGEgbW9kaWZpY2FjacOzbiBkZWwgCkRlY3JldG8gTGVnaXNsYXRpdm8gTsKwODIyLCBMZXkgc29icmUgZWwgRGVyZWNobyBkZSBBdXRvciBwcm9tdWxnYWRvIGVuIDIwMDggCihELkwuIE7CsDEwNzYpLgoKT2JzZXJ2YWNpb25lczoKCkluc2NyaWJpcnNlIGVuIENyZWF0aXZlIENvbW1vbnMgQkFOCiAK
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