Regulación del crecimiento de yemas florales en Tarwi (Lupinus mutabilis Sweet) por RNA - SEQ

Descripción del Articulo

Universidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de Posgrado. Maestría en Mejoramiento Genético de Plantas
Detalles Bibliográficos
Autor: Ramos Otiniano, Cynthia Catheryne
Formato: tesis de maestría
Fecha de Publicación:2021
Institución:Universidad Nacional Agraria La Molina
Repositorio:UNALM-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/5143
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12996/5143
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Lupinus mmutabilis
Variedades
Brotación
Regulación
Sustancias de crecimiento vegetal
Dosis de aplicación
Yema (Planta)
Etapas de desarrollo de la planta
Rendimiento de cultivos
Diseño experimental
Evaluación
Perú
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El secuenciamiento Illumina y análisis bioinformático mostró 2340 genes diferencialmente expresados (DEGs), con 1443 genes sobreexpresados, y 897 subexpresados. La ontología génica mostró 584 genes sobreexpresados y 84 subexpresados relacionados con proceso biológico; 782 genes estuvieron sobreexpresados y 228 subexpresados en componente celular; 877 genes sobreexpresados y 156 subexpresados se encontraron en función molecular. En el análisis de rutas metabólicas, la biosíntesis de metabolitos secundarios, biosíntesis de fenolpropanoides, e interconversión de pentosas y glucuronato se activaron durante el desarrollo de la inflorescencia. Los DEGs más importantes en el desarrollo de la inflorescencia en tarwi fueron factor de transcripción IIIA, diana de monópteros 6, AGAMOUS-LIKE30. Este estudio proporcionó las bases para comprender los mecanismos genéticos que regulan el crecimiento y desarrollo de la inflorescencia del tarwi para ser aplicados en programas de mejoramiento genético.Tarwi (Lupinus mutabilis Sweet) is important for its high macro and micronutrients. Seed production depends on flowering; thus, it is essential to understand the genetic mechanisms of regulation. The objective of this research was to analyze changes in genetic expression in tarwi during the growth of flower buds, by RNA-seq. Selection by precocity, 100-seed weight, water stress survival, microelements and total soluble protein contents determined the high potential of accession P11. Illumina sequencing and bioinformatic analysis showed 2340 differentially expressed genes (DEGs) with 1443 upregulated genes and 897 downregulated ones. Gen ontology showed 584 upregulated genes and 84 downregulated genes related to biological process; 782 genes were upregulated and 228 downregulated in cellular component; 877 upregulated genes and 156 downregulated genes were found in molecular function. In the metabolic pathways analysis, secondary metabolite biosynthesis, phenolpropanoid biosynthesis and pentose and glucuronate interconversions were activated during flower development. The most important DEGs in tarwi flower development were transcription factor IIIA, target of monoptera 6 and AGAMOUS-LIKE30. This study provided the basis to understand the genetic mechanisms that regulated flower bud growth and development in tarwi, to be applied in tarwi improvement programs.application/pdfspaUniversidad Nacional Agraria La MolinaPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/Lupinus mmutabilisVariedadesBrotaciónRegulaciónSustancias de crecimiento vegetalDosis de aplicaciónYema (Planta)Etapas de desarrollo de la plantaRendimiento de cultivosDiseño experimentalEvaluaciónPerúhttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.01.07Regulación del crecimiento de yemas florales en Tarwi (Lupinus mutabilis Sweet) por RNA - SEQinfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionreponame:UNALM-Institucionalinstname:Universidad Nacional Agraria La Molinainstacron:UNALMSUNEDUMejoramiento Genético de PlantasUniversidad Nacional Agraria La Molina. Escuela de PosgradoMagister Scientiae - Mejoramiento Genético de Plantas45029250https://orcid.org/0000-0002-2366-6310https://orcid.org/0000-0002-0432-10500605813807999863https://purl.org/pe-repo/renati/type#tesishttps://purl.org/pe-repo/renati/level#maestro511307Sevilla Panizo, RicardoHuaringa Joaquín, AmeliaEgúsquiza Bayona, RolandoORIGINALramos-otiniano-cynthia-catheryne.pdframos-otiniano-cynthia-catheryne.pdfTexto completoapplication/pdf5438285https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/b974dfce-cd71-483f-a4df-c9f47250b2a9/download917b6a244211354ea94e1f939856ad3cMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81664https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/fc30bdc3-a9c8-45c6-858c-8ce14084e29e/download97c5bee00fbb4c4f8867bd742b579336MD52TEXTramos-otiniano-cynthia-catheryne.pdf.txtramos-otiniano-cynthia-catheryne.pdf.txtExtracted texttext/plain165941https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/d91a2c3c-9aab-4b4f-8a33-88117709c2d2/downloade61227c6b1b36f5670d9303780bcb528MD53THUMBNAILramos-otiniano-cynthia-catheryne.pdf.jpgramos-otiniano-cynthia-catheryne.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3387https://repositorio.lamolina.edu.pe/bitstreams/6b713378-3035-4d67-b463-37b48dea1c7b/downloadbe0d2e3e46558ed7ba3fdaa5893d1a82MD5420.500.12996/5143oai:repositorio.lamolina.edu.pe:20.500.12996/51432023-01-05 04:33:55.122https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccessopen.accesshttps://repositorio.lamolina.edu.peRepositorio Universidad Nacional Agraria La Molinadspace@lamolina.edu.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