AN APPLICATION OF GIBBS SAMPLING FOR GENETIC PARAMETERS ESTIMATION IN GUINEA PIGS USING MCMCGLMM

Descripción del Articulo

The aim of this study was to estimate genetic parameters for birth and weaning weight in guinea pigs (Cavia porcellus) reared in a farm in Cieneguilla, Lima, Peru. Univariate animal model that included sex of calf, parity, season of birth, animal and litter effect was used in the genetic analyses. I...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autores: Vargas P., Ana, Gutiérrez R., Gustavo, Mamani M., Gerardo
Formato: artículo
Fecha de Publicación:2015
Institución:Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Repositorio:Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcos
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:ojs.csi.unmsm:article/11095
Enlace del recurso:https://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/veterinaria/article/view/11095
Nivel de acceso:acceso abierto
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spelling AN APPLICATION OF GIBBS SAMPLING FOR GENETIC PARAMETERS ESTIMATION IN GUINEA PIGS USING MCMCGLMMUna Aplicación del Muestreo de Gibbs en la Estimación de Parámetros Genéticos en Cuyes Utilizando MCMCglmmVargas P., AnaGutiérrez R., GustavoMamani M., Gerardoheredabilityanimal modelMCMCglmmheredabilidadmodelo animalMCMCglmmThe aim of this study was to estimate genetic parameters for birth and weaning weight in guinea pigs (Cavia porcellus) reared in a farm in Cieneguilla, Lima, Peru. Univariate animal model that included sex of calf, parity, season of birth, animal and litter effect was used in the genetic analyses. In addition, the effect of number of newborns was included in the model for birth weight, and the number of born alive and age at weaning were included in the model for weaning weight. Variance components were estimated by Bayesian Gibbs sampling with a chain of100 000 rounds with the first 10 000 rounds discarded for burn-in by using MCMCglmm library of R software. Heritability estimates for birth weight was 0.155 ± 0.036 and for weaning weight was 0.246 ± 0.046. These values were similar to those estimated by using REML.El objetivo de este estudio fue estimar parámetros genéticos para el peso al nacimiento y peso al destete en cuyes (Cavia porcellus) de una granja en Cieneguilla, Lima, Perú. Para el análisis se utilizó un modelo animal univariado que incluyeron los factores sexo de la cría, número de parto, estación, animal y camada. Además, para el peso al nacimiento se incluyó como factor el total de nacidos y para el peso al destete se incluyeron como factores el número de nacidos vivos y edad de la cría. Se estimaron los componentes de variancia utilizando el análisis bayesiano vía muestreo de Gibbs utilizando la librería MCMCglmm del software R. Se corrió una cadena de 100 000 iteraciones de las cuales fueron descartadas las 10 000 primeras. El valor estimado de heredabilidad para el peso al nacimiento fue de 0.155 ± 0.036 y para el peso al destete fue de 0.246 ± 0.046; resultados similares a los reportados utilizando REML.Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Medicina Veterinaria2015-06-03info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/veterinaria/article/view/1109510.15381/rivep.v26i2.11095Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú; Vol. 26 Núm. 2 (2015); 182-188Revista de Investigaciones Veterinarias del Perú; Vol. 26 No. 2 (2015); 182-1881682-34191609-9117reponame:Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstname:Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstacron:UNMSMspahttps://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/veterinaria/article/view/11095/10048Derechos de autor 2015 Ana Vargas P., Gustavo Gutiérrez R., Gerardo Mamani M.https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0info:eu-repo/semantics/openAccessoai:ojs.csi.unmsm:article/110952020-03-29T18:48:30Z
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