Exact and kernelization algorithms for Closet String
Descripción del Articulo
In this paper we address CLOSEST STRING problem that arises in web searching, coding theory and computational molecular biology. To solve it is to find a string that minimizes the maximum Hamming distance from a given set of strings. CLOSEST STRING is an NP-hard problem. This paper proposes two line...
| Autor: | |
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| Formato: | artículo |
| Fecha de Publicación: | 2020 |
| Institución: | Universidad Nacional de Trujillo |
| Repositorio: | Revista UNITRU - Selecciones Matemáticas |
| Lenguaje: | inglés |
| OAI Identifier: | oai:ojs.revistas.unitru.edu.pe:article/3080 |
| Enlace del recurso: | http://revistas.unitru.edu.pe/index.php/SSMM/article/view/3080 |
| Nivel de acceso: | acceso abierto |
| Materia: | Closest String Problem Combinatorial Optimization Exact Algorithm Fixed Parameter Algorithm Kernelization Problema de la subsecuencia de caracteres más próxima Optimización combinatoria Algoritmo exacto Algoritmo de parámetro fijo Kernelización |
| Sumario: | In this paper we address CLOSEST STRING problem that arises in web searching, coding theory and computational molecular biology. To solve it is to find a string that minimizes the maximum Hamming distance from a given set of strings. CLOSEST STRING is an NP-hard problem. This paper proposes two linear-time algorithms, one for the general case, a kernelization algorithm, and the other for three-strings, a linear-time algorithm called Minimization First Algorithm (MFA). A formal proof of the correctness and the computational complexity of the proposed algorithms are given. |
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Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).
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