La colección entomológica del Museo de Historia Natural de la UNFV es un tesoro invaluable de especímenes de insectos conservados y catalogados para su estudio científico. Esta colección contiene una amplia variedad de especies, desde Atta cephalotes, Camponotus incompositus, Linepithema neotropicum, Tetramorium sp., Dolichopodidae sp. y otras, representando la diversidad de la fauna insectil. Cada especimen está etiquetado con información detallada sobre su origen, hábitat y fecha de recolección. Estos datos proporcionan una ventana única a la biodiversidad y ecología de diferentes regiones y ecosistemas del Perú a lo largo del tiempo.

La colección zoológica e hidrobiológica del Museo de Historia Natural de la Universidad Nacional Federico Villarreal es una compilación meticulosa de especímenes de animales terrestres y acuáticos, que abarcan desde murciélagos, peces, anfibios, serpientes, reptiles y mamíferos. Estos especímenes están cuidadosamente preservados y catalogados con información detallada sobre su taxonomía, hábitat y distribución geográfica. Esta colección es una herramienta de gran valor para la investigación científica, proporcionando datos cruciales para estudios de biodiversidad, ecología y conservación. Los investigadores pueden analizar patrones de distribución geográfica, cambios en la abundancia de especies y adaptaciones biológicas a lo largo del tiempo.

La colección: inventario biológico MUFV-CITES constituye un conjunto de especímenes representativos de la biodiversidad del país, recolectados durante estudios de campo en diversas ecorregiones. Esta colección, que incluye plantas y animales, está identificada y documentada con información de clase, familia, género, especie y geografía.

La colección "Herbarios" del Museo de Historia Natural de la Universidad Nacional Federico Villarreal constituye un valioso archivo de la diversidad vegetal del país. Esta colección reúne especímenes de plantas provenientes de diversas regiones desde la Amazonía hasta los Andes y la costa. Cada ejemplar está acompañado de datos como: familia, género, nombre científico, hábito, suelo, color de la flor, etc.