En los Andes del Perú habita Puya raimondii donde se encontraron diferencias morfológicas (morfotipos) en las poblaciones, motivo que ha impulsado al desarrollo de marcadores microsatélites específicos para la especie. El objetivo de la investigación fue evaluar la diversidad genética y estructura genética de las poblaciones de Choconchaca (Puno), Pachapaqui (Ancash) y Yanacancha (Junín) para establecer futuras unidades de conservación. Los parámetros de diversidad genética utilizados incluyeron número de alelos (A), alelos exclusivos (AR), heterocigosidad observada (Ho), heterocigosidad esperada (He), índice de contenido polimórfico (PCI). Los resultados mostraron que 12 de los 46 loci microsatélites fueron polimórficos y todos aportan información en el análisis de la diversidad genética poblacional, el número total de A varió de 2-13, los valores He varió de 0-0.7...