Objetivo: Determinar la relación entre el saneamiento básico e higiene de manos con la incidencia de COVID-19 en la población rural del Perú en el 2020. Métodos: Se realizó un análisis secundario de datos de la Encuesta Nacional de Programas Presupuestales (ENAPRES) 2019, incluyendo 15 067 viviendas y 51 145 entrevistados; se comparó las regiones rurales del Perú dividiéndose en regiones con mayor y menor número de casos de COVID-19. Resultados: Se evidenció que un limitado acceso diario al servicio de agua (RPa=1.23; IC 95% 1.19 – 1.28 y P<0,001), un nivel inadecuado de cloro (RPa=1.69; IC 95% 1.45 – 1.96 y P<0,001) o la ausencia de cloro en el agua (RPa=1.90; IC 95% 1.66 – 2.17 y P<0,001), los servicios higiénicos conectados a pozo, tanque séptico o biodigestor (RPa=1.20; IC 95% 1.12 – 1.29 y P<0,001), a pozo ciego o negro (RPa=1.16; IC 95% 1.10 – 1.22 y P<0,001...