En Bioinformática intentan definir modelos matemáticas de sistemas biológicos usando grandes cantidades de Unidades de Procesamiento Centra- les (CPUs), generando aplicaciones poco prácticas. Esto esta´ siendo optimizado por paralelismo usando unidad de Procesamiento Gráficos (GPU) y sistemas distribuidos. En este trabajo se presenta dos algoritmos de optimización del al- goritmo Basic Local Alignment Search Tool (BLAST), basado en tablas Hash, para el alineamiento de una secuencia (unisecuencial) y para el alineamiento de múltiples secuencias (multisecuencial) de consulta de Ácido Desoxirribonuclei- co (ADN), usando técnicas masivamente paralelas y distribuidas, mediante el modelo de programación con Compute Unified Device Architecture (CUDA) y uso de la GPU. Comparando su rendimiento en implementaciones secuenciales usando CPUs e implementaciones con la GPU. Evaluando su ren...