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Publicado 2017
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Spermidine is a polyamine compound found in fruits, vegetables, meats and milk products. It is also known for its role as a modulator of functions for DNA, RNA, nucleotide triphosphates and proteins. Some recent experimental studies have shown that it has an inhibitory function on the protein related to the pathogenesis of myotonic dystrophy type 1 (MBNL‐1), providing some hope in relation to this disease presently without cure. However these studies have not provided sufficient information to explain its inhibitory role. In the present work, the existing interaction between spermidine and the MBNL‐1 protein has been confirmed by computational chemistry. The quantum mechanics analysis was carried out with the CAM‐B3LYP density functional, using a TZVP basis set. For the molecular mechanics, the OPLS‐AA force field was used, followed immediately by the solvation of the MBNL‐1 pr...
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Publicado 2017
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La Espermidina es un poliamina que podemos encontrar en frutas, verduras, productos cárnicos y lácteos; además de ser conocida por su papel modulador de funciones del ADN, ARN, nucleótidos trifosfatos y proteínas. Según, estudios experimentales recientes demostraron que cumple una función inhibitoria sobre la proteína relacionada con la patogénesis de la distrofia miotónica tipo 1 (MBNL‐1) dando luces a esta enfermedad aun sin cura; sin embargo, estos estudios no han proporcionado suficientes datos para aclarar su capacidad inhibitoria. En este trabajo se comprobó la interacción existente entre la espermidina y la proteína MBNL‐1 mediante química computacional. El análisis mediante el uso de mecánica cuántica (QM) se llevó a cabo con la funcional CAM‐ B3LYP usando un set de base TZVP. En relación a la mecánica molecular (MM) se utilizó un campo de fuerza OPLS...