El presente trabajo se realizó en el laboratorio de Biotecnología y Diversidad Molecular de la Universidad Nacional Agraria de la Selva – Tingo María y en el Centro de Genómica de la Universidad de Minnesota (Estados Unidos), teniendo como objetivo la evaluación de la estructura genética poblacional de una colección nacional de cacao fino y de aroma utilizando SNP’s obtenidas a través de Genotyping by Sequencing y la identificación de patrones únicos en cada grupo genético o poblacional. Se realizaron extracciones con el método de CTAB modificado, aislamientos y purificaciones de ADN, para determinar la calidad de este utilizando el instrumental Qu-bit, en hojas jóvenes de árboles diferenciados y representativos colectados en las regiones de Piura, Amazonas, Loreto, Cuzco, Huánuco, San Martín y Ecuador, para la respectiva caracterización molecular SNP, asimismo, se r...