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tesis de grado
En la presente investigación se realizó el análisis de la interacción de 78 ciclótidos de la familia Rubiaceae con un dodecámero de beta amiloide; obteniendo en una primera instancia las estructuras reportadas en la literatura, tanto como de los ciclótidos como de la beta amiloide, las cuales fueron modeladas, optimizadas y alcanzaron el equilibrio mediante el uso de técnicas de Mecánica Molecular como la minimización de energías y dinámica molecular, utilizando el ensamble canónico NVT por un tiempo de 200ns, el campo de fuerza OPLSAA, y un solvente explícito (SPC216). El acoplamiento molecular entre la beta amiloide y los 78 ciclótidos respectivamente y post procesamiento con una dinámica molecular de 10ns, nos mostró que llega a existir una interacción entre los ciclótidos con la proteína de beta amiloide al observar la existencia de puentes hidrógeno; solo un cic...