En la Región Pasco existe gran número de empresas que califican como Mypes, de las cuales en su mayoría son Micro Empresas y el resto Pequeñas Empresas. El propósito de la presente tesis, es determinar si el resultado de la Auditoria Tributaria influye en la Gestión Administrativa de las Mypes. El enfoque ha sido tratado en base al problema fiscal que tienen estas empresas por parte de la Sunat. La población y muestra de la investigación fue establecido en 350 y 50 Mypes y Profesionales respectivamente. Los resultados revelan que las Mypes incumplen sus obligaciones tributarias y por ello pagan multas y reintegran tributos, lo cual sin duda afecta su gestión administrativa.