El presente estudio sobre análisis de la variabilidad genética de los micro satélites PENTA D y D16S539 en la población de la región sur del Perú se realizó con la finalidad de establecer los parámetros genético poblacionales en la población humana de la Región del Sur del Perú para los marcadores STRs ya mencionados. Se estudiaron 100 muestras de individuos que acudieron al Centro de Biología Molecular de la Universidad Nacional de San Agustín entre los años 2010 y 2014. Se incluyeron a pacientes mayores de 18 años que no tenían ninguna ascendencia familiar o parentesco dos generaciones atrás nacidas en la Región Sur del Perú. La muestra de ADN se obtuvo de la mucosa bucal utilizando el método Master Pure Kid de Miller. Para el análisis bioinformático de los STRs los programas Genetix, Genopop y Cervus. Encontramos para el marcador D16S539 los alelos 9, 10, 11, 12...