Relación de los fenotipos acetiladores del gen Nat2 con la injuria hepática inducida por fármacos antituberculosos en pacientes peruanos Universidad de San Martín de Porres 2016-2017

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RESUMEN Objetivo: Relacionar los fenotipos acetiladores del gen NAT2 con la injuria hepática inducida por fármacos antituberculosos (IHIMA) en pacientes peruanos. Metodología: Se evaluó pacientes tuberculosos con y sin injuria hepática (30 en cada grupo) según criterio Drug-Induced Liver Injury Netw...

Descripción completa

Detalles Bibliográficos
Autor: Laymito Chumbimuni, Lina Rocío
Formato: tesis de maestría
Fecha de Publicación:2020
Institución:Universidad de San Martín de Porres
Repositorio:USMP-Institucional
Lenguaje:español
OAI Identifier:oai:repositorio.usmp.edu.pe:20.500.12727/6468
Enlace del recurso:https://hdl.handle.net/20.500.12727/6468
Nivel de acceso:acceso abierto
Materia:Tuberculosis
Enfermedad hepática inducida por sustancias y drogas
Antituberculosos
Perú
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description RESUMEN Objetivo: Relacionar los fenotipos acetiladores del gen NAT2 con la injuria hepática inducida por fármacos antituberculosos (IHIMA) en pacientes peruanos. Metodología: Se evaluó pacientes tuberculosos con y sin injuria hepática (30 en cada grupo) según criterio Drug-Induced Liver Injury Network (DILIN). Se empleó técnicas moleculares como RFLP, Secuenciamiento Sanger, NGS (Target sequencing y Exome sequencing) para registrar los diferentes genotipos de NAT2. El análisis bioinformático incluyó la anotación de variantes genéticas conocidas y nuevas con diversas herramientas de predicción clínico utilizando los programas VarScan, VEP, SnpEff y SnpSift. Resultados: Se evaluó las variantes rs1799929, rs1799930 y rs1799931 para definir fenotipos acetiladores del gen NAT2, encontrándose diferencias no significativas entre el grupo IHIMA (SA=43%, IA=43% y RA=14%) y No-IHIMA (SA=40%, IA=56% y RA=4%) con un OR 1.14 95% IC [0.41-3.2] p= 0.7934. También se encontraron cuatro variantes nuevas que se desconoce su relación con la condición IHIMA. Conclusión: No existe relación los fenotipos acetiladores del gen NAT2 con la injuria hepática inducida por fármacos antituberculosos (IHIMA) en esta muestra de pacientes peruanos, sin embargo, es importante destacar que los fenotipos acetiladores NAT2 lento, tienen una frecuencia media en ambos grupos IHIMA y No-IHIMA.
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El análisis bioinformático incluyó la anotación de variantes genéticas conocidas y nuevas con diversas herramientas de predicción clínico utilizando los programas VarScan, VEP, SnpEff y SnpSift. Resultados: Se evaluó las variantes rs1799929, rs1799930 y rs1799931 para definir fenotipos acetiladores del gen NAT2, encontrándose diferencias no significativas entre el grupo IHIMA (SA=43%, IA=43% y RA=14%) y No-IHIMA (SA=40%, IA=56% y RA=4%) con un OR 1.14 95% IC [0.41-3.2] p= 0.7934. También se encontraron cuatro variantes nuevas que se desconoce su relación con la condición IHIMA. Conclusión: No existe relación los fenotipos acetiladores del gen NAT2 con la injuria hepática inducida por fármacos antituberculosos (IHIMA) en esta muestra de pacientes peruanos, sin embargo, es importante destacar que los fenotipos acetiladores NAT2 lento, tienen una frecuencia media en ambos grupos IHIMA y No-IHIMA.Objective: Relate the acetylating phenotypes of NAT2 gene with liver injury induced by anti-tuberculosis drugs (IHIMA) in Peruvian patients. Methodology: Tuberculosis patients with and without liver injury (30 in each group) were evaluated according to the Drug-Induced Liver Injury Network (DILIN) criteria. Molecular techniques such as RFLP, Sanger Sequencing, NGS (Target sequencing and Exome sequencing) were used to record genotypes and alleles of the genetic variants of the gene. Bioinformatic analysis included annotation of new and known genetic variants with various clinical prediction tools using the VarScan, VEP, SnpEff and SnpSift programs. Results: Variants rs1799929, rs1799930 and rs1799931 were evaluated to define acetylating phenotypes of NAT2 gene, finding non-significant differences between the IHIMA group (SA = 43%, IA = 43% and RA = 14%) and Non-IHIMA (SA = 40%, IA = 56% and RA = 4%) with an OR 1.14 95% CI [0.41-3.2] p = 0.7934. Four new variants were also found that are not related to IHIMA. Conclusion: There is no relationship between the acetylating phenotypes of NAT2 gene with liver injury induced by antituberculous drugs (IHIMA) in this sample of Peruvian patients, however, it is important to highlight that the slow and intermediate NAT2 acetylating phenotypes have an average frequency in both IHIMA and No-IHIMA groups.Perú. Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (Concytec). Fondo Nacional de Desarrollo Científico, Tecnológico y de Innovación Tecnológica (Fondecyt). Proyecto de investigación: Perfil inmunogenómico y farmacogenomico para determinar la predisposición a hepatotoxicidad por tratamiento antituberculoso en pacientes peruanos. Número de contrato: CONV-000090-2014-FONDECYT-DE57 p.spaUniversidad de San Martín de PorresPEinfo:eu-repo/semantics/openAccesshttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/Repositorio Académico USMPUniversidad San Martín de Porres - USMPreponame:USMP-Institucionalinstname:Universidad de San Martín de Porresinstacron:USMPTuberculosisEnfermedad hepática inducida por sustancias y drogasAntituberculososPerúhttps://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.02.00Relación de los fenotipos acetiladores del gen Nat2 con la injuria hepática inducida por fármacos antituberculosos en pacientes peruanos Universidad de San Martín de Porres 2016-2017info:eu-repo/semantics/masterThesisSUNEDUMaestra en Inmunología con mención en Infectología y Enfermedades AutoinmunesUniversidad de San Martín de Porres. Facultad de Medicina Humana. Sección de PosgradoInmunología con mención en Infectología y Enfermedades Autoinmunes0945657045645076021207De León Delgado, JoséValencia Ayala, EdwardPareja Cruz, Arturohttps://purl.org/pe-repo/renati/level#maestrohttps://purl.org/pe-repo/renati/type#tesisORIGINALlaymito_clr.pdflaymito_clr.pdfTrabajoapplication/pdf1986942https://repositorio.usmp.edu.pe/bitstream/20.500.12727/6468/1/laymito_clr.pdf586a0192ed938fedb6b3494e35bd0241MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.usmp.edu.pe/bitstream/20.500.12727/6468/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTlaymito_clr.pdf.txtlaymito_clr.pdf.txtExtracted texttext/plain72494https://repositorio.usmp.edu.pe/bitstream/20.500.12727/6468/3/laymito_clr.pdf.txt50b4e0c05616f4c002dbfd1a9de57731MD53THUMBNAILlaymito_clr.pdf.jpglaymito_clr.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg5081https://repositorio.usmp.edu.pe/bitstream/20.500.12727/6468/4/laymito_clr.pdf.jpga1b6abe4b511eabb02449ba41c242b45MD5420.500.12727/6468oai:repositorio.usmp.edu.pe:20.500.12727/64682024-10-09 11:32:16.071REPOSITORIO ACADEMICO USMPrepositorio@usmp.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