Estructura genética de cepas de Mycobacterium tuberculosis drogorresistentes usando el ensayo de sonda lineal GenoType MTBDRplus v2.0 en el Perú, periodo 2011-2015

• Autor: Santos Lázaro, Elías David
• Formato: tesis de grado
• Fecha de Publicación: 2020
• Institución: Universidad Nacional Mayor de San Marcos
• Repositorio: UNMSM-Tesis
• Lenguaje: español
• OAI Identifier: oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:20.500.12672/15708
• Enlace del recurso: https://hdl.handle.net/20.500.12672/15708
• Nivel de acceso: acceso abierto
• Materia: Mycobacterium tuberculosis; Genética bacteriana; https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#3.03.08; https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.07; https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.02.03

En el Perú, la tuberculosis (TB) constituye un importante problema de salud pública, en especial, los casos producidos por cepas drogorresistentes de Mycobacterium tuberculosis (MTB). Se caracteriza haplotipos de cepas drogorresistentes de MTB y evaluar sus distribuciones a nivel nacional. Se crearon “haplotipos resistentes” mediante la concatenación de 21 sitios polimórficos (genes rpoB, katG e inhA) evaluados por el ESL GenoType MTBDRplus v2.0. Se analizaron 6589 resultados de diagnóstico molecular realizados por el Instituto Nacional de Salud durante los años 2013-2015, así como resultados de diagnóstico fenotípico obtenidos por el método de proporciones en Agar 7H10. Se determinó la existencia de 3702 (56.26%) casos de TB-MDR, 2218 (33.7%) casos monorresistentes a isoniacida, y 669 (10.2%) casos monorresistentes a rifampicina. Las mutaciones de mayor prevalencia fueron: rpoB D516V, rpoB S531L, katG S315T e inhA c-15t. Se evidenció un fuerte desequilibrio de ligamiento entre los sitios polimórficos analizados (rBarD=0.0215). Se obtuvieron 134 haplotipos resistentes con un alto poder discriminatorio (IDHG=0.89), de los cuales 13 representaron al 87.9% del total de muestras analizadas. A nivel nacional, 22 localidades presentaron una alta biodiversidad de haplotipos resistentes, 04 una biodiversidad intermedia y 02 una baja biodiversidad. Se detectaron 231 casos discordantes de resistencia a rifampicina, posiblemente asociados con mutaciones controversiales. Concluye que el análisis de haplotipos y mutaciones obtenidos por el ESL GenoType MTBDRplus v2.0 permite determinar la estructura de los principales genes determinantes de resistencia a rifampicina e isoniacida en las cepas drogorresistentes de MTB que circulan a nivel nacional.