Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo
Descripción del Articulo
This work uses bioinformatics tools and free online access to genomic information in order to identify and characterize proteins related to oxidative stress defense of Mycobacterium tuberculosis, in order to disco ver new appropriate pharmacological targets against this pathogen. Sequences of amino...
| Autor: | |
|---|---|
| Formato: | artículo |
| Fecha de Publicación: | 2005 |
| Institución: | Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| Repositorio: | Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| Lenguaje: | español |
| OAI Identifier: | oai:ojs.csi.unmsm:article/5225 |
| Enlace del recurso: | https://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/farma/article/view/5225 |
| Nivel de acceso: | acceso abierto |
| Materia: | Mycobacterium tuberculosis oxidative stress bioinformatics genome molecular modeling estrés oxídatívo bioinformática genoma modelaje molecular |
| id |
REVUNMSM_d9c39aa1988aac7326640650bdff5cba |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:ojs.csi.unmsm:article/5225 |
| network_acronym_str |
REVUNMSM |
| network_name_str |
Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| repository_id_str |
|
| spelling |
Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativoModelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativoSolis Calero, ChristianMycobacterium tuberculosisoxidative stressbioinformaticsgenomemolecular modelingMycobacterium tuberculosisestrés oxídatívobioinformáticagenomamodelaje molecularThis work uses bioinformatics tools and free online access to genomic information in order to identify and characterize proteins related to oxidative stress defense of Mycobacterium tuberculosis, in order to disco ver new appropriate pharmacological targets against this pathogen. Sequences of amino acids of proteins expressed with that function, products of the expression of the genes katG, sodA, sodC, ahpC, ahpD and mgtC were compared with the genome of Mycobacterium tuberculosis H37Rv through the NCBI server National for Center Biotechnology Information), determining their possible redundancy in the genome. Parallely, information was obtained above of their evolutive conserved sequences by global multiply alignment using MAXHOM program, as well models of their threedimensionalstructures by comparative modeling method through the Swiss-model server, or using «recognition of folding» method (threading) through the GENESILICO metaserver. By genomic analysis, proteins codified by katG, ahpD and mgtC genes would be very good candidates to be pharmacological targets due to absence of redundancy in the genome of Mycobacterium tuberculosis as well as similarity with any codified protein by human genes.En el presente trabajo se describe el uso de procedimientos bioinformáticos e información genómica de acceso libre por Internet, para identificar y caracterizar proteínas que participan en la defensa de Mycobacterium tuberculosis (MT) frente al estrés oxidativo, con el propósito de obtener nuevos blancos farmacológicos en este patógeno. Las secuencias de aminoácidos de las proteínas correspondientes a los genes katG, ahpC, ahpD, sodA, sodC y mgtC fueron comparadas con el genoma de Mycobacteríum tuberculosis H37Rv a través del servidor del National Center for Biotechnology Information, determinando su posible redundancia en el genoma. Paralelamente, se obtuvo información sobre sus residuos más conservados evolutivamente por alineamiento múltiple global usando el programa MAXHOM, así como modelos de sus estructuras tridimensionales usando los métodos de «modelaje molecular comparativo» a través del servidor SWISS-MODEL o modelaje por el método de «reconocimiento de plegamiento» (threading) a través del metaservidor GENESILICO. En base al análisis genómico se puede concluir que las proteínas codificadas por los genes katG, ahpD y mgtC son buenos candidatos como blancos farmacológicos debido a que no tienen similaridad significativa con alguna proteína codificada por genes presentes en el genoma humano y no presentan redundancia en el genoma del Mycobacterium tuberculosis.Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Farmacia y Bioquímica2005-06-13info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttps://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/farma/article/view/522510.15381/ci.v8i1.5225Ciencia e Investigación; Vol. 8 Núm. 1 (2005); 33-39Ciencia e Investigación; Vol. 8 No. 1 (2005); 33-391609-90441561-0861reponame:Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstname:Universidad Nacional Mayor de San Marcosinstacron:UNMSMspahttps://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/farma/article/view/5225/4308Derechos de autor 2005 Christian Solis Calerohttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0info:eu-repo/semantics/openAccessoai:ojs.csi.unmsm:article/52252020-04-24T16:13:01Z |
| dc.title.none.fl_str_mv |
Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo |
| title |
Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo |
| spellingShingle |
Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo Solis Calero, Christian Mycobacterium tuberculosis oxidative stress bioinformatics genome molecular modeling Mycobacterium tuberculosis estrés oxídatívo bioinformática genoma modelaje molecular |
| title_short |
Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo |
| title_full |
Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo |
| title_fullStr |
Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo |
| title_full_unstemmed |
Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo |
| title_sort |
Modelaje de proteínas de Mycobacterium tuberculosis relacionadas a su defensa frente al estrés oxidativo |
| dc.creator.none.fl_str_mv |
Solis Calero, Christian |
| author |
Solis Calero, Christian |
| author_facet |
Solis Calero, Christian |
| author_role |
author |
| dc.subject.none.fl_str_mv |
Mycobacterium tuberculosis oxidative stress bioinformatics genome molecular modeling Mycobacterium tuberculosis estrés oxídatívo bioinformática genoma modelaje molecular |
| topic |
Mycobacterium tuberculosis oxidative stress bioinformatics genome molecular modeling Mycobacterium tuberculosis estrés oxídatívo bioinformática genoma modelaje molecular |
| description |
This work uses bioinformatics tools and free online access to genomic information in order to identify and characterize proteins related to oxidative stress defense of Mycobacterium tuberculosis, in order to disco ver new appropriate pharmacological targets against this pathogen. Sequences of amino acids of proteins expressed with that function, products of the expression of the genes katG, sodA, sodC, ahpC, ahpD and mgtC were compared with the genome of Mycobacterium tuberculosis H37Rv through the NCBI server National for Center Biotechnology Information), determining their possible redundancy in the genome. Parallely, information was obtained above of their evolutive conserved sequences by global multiply alignment using MAXHOM program, as well models of their threedimensionalstructures by comparative modeling method through the Swiss-model server, or using «recognition of folding» method (threading) through the GENESILICO metaserver. By genomic analysis, proteins codified by katG, ahpD and mgtC genes would be very good candidates to be pharmacological targets due to absence of redundancy in the genome of Mycobacterium tuberculosis as well as similarity with any codified protein by human genes. |
| publishDate |
2005 |
| dc.date.none.fl_str_mv |
2005-06-13 |
| dc.type.none.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| format |
article |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.none.fl_str_mv |
https://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/farma/article/view/5225 10.15381/ci.v8i1.5225 |
| url |
https://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/farma/article/view/5225 |
| identifier_str_mv |
10.15381/ci.v8i1.5225 |
| dc.language.none.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.relation.none.fl_str_mv |
https://revistasinvestigacion.unmsm.edu.pe/index.php/farma/article/view/5225/4308 |
| dc.rights.none.fl_str_mv |
Derechos de autor 2005 Christian Solis Calero https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0 info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Derechos de autor 2005 Christian Solis Calero https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0 |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Farmacia y Bioquímica |
| publisher.none.fl_str_mv |
Universidad Nacional Mayor de San Marcos, Facultad de Farmacia y Bioquímica |
| dc.source.none.fl_str_mv |
Ciencia e Investigación; Vol. 8 Núm. 1 (2005); 33-39 Ciencia e Investigación; Vol. 8 No. 1 (2005); 33-39 1609-9044 1561-0861 reponame:Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcos instname:Universidad Nacional Mayor de San Marcos instacron:UNMSM |
| instname_str |
Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| instacron_str |
UNMSM |
| institution |
UNMSM |
| reponame_str |
Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| collection |
Revistas - Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| repository.name.fl_str_mv |
|
| repository.mail.fl_str_mv |
|
| _version_ |
1795238296878579712 |
| score |
13.924112 |
Nota importante:
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).
La información contenida en este registro es de entera responsabilidad de la institución que gestiona el repositorio institucional donde esta contenido este documento o set de datos. El CONCYTEC no se hace responsable por los contenidos (publicaciones y/o datos) accesibles a través del Repositorio Nacional Digital de Ciencia, Tecnología e Innovación de Acceso Abierto (ALICIA).