Isolation of bacteria with bioremediation potential and analysis of bacterial communities in an area affected by an oil spill in Condorcanqui (Amazonas, Peru)

• Autores: Castillo Rogel, Rosita T., More Calero, Francis J., Cornejo La Torre, Melitza, Fernández Ponce, Jaime N., Mialhe Matonnier, Eric L-
• Formato: artículo
• Fecha de Publicación: 2020
• Institución: Universidad Nacional del Altiplano
• Repositorio: Revista UNAP - Revista de Investigaciones Altoandinas - Journal of High Andean Research
• Lenguaje: español
• OAI Identifier: oai:huajsapata.unap.edu.pe:article/94
• Enlace del recurso: https://huajsapata.unap.edu.pe/index.php/ria/article/view/94
• Nivel de acceso: acceso abierto
• Materia: water; bacteria; hydrocarbons; metagenomics; soil; agua; bacterias; hidrocarburos; metagenómica; suelo

The use of oil and its derivatives has been intensified by the current high energy demand, but brought with it the increase in environmental accidents such as fuel spills that negatively affect ecosystems. In those environments there are microorganisms capable of surviving such conditions and using petroleum hydrocarbons as a source of carbon and energy; those can be used in bioremediation, with an eco-friendly and cost-effective approach. In this work, bacterial strains with bioremediation potential were isolated and identified in culture media supplemented with oil from an area contaminated from an oil spill in the Peruvian Amazon; also was done out the characterization of the bacterial community   by independent analysis of culture by means of next generation sequencing directed to the 16S rRNA gene. The isolated bacterial strains were identified as Acinetobacter rudis, Enterobacter cloacae, Klebsiella oxytoca, Morganella morganii, Proteus hauseri, Proteus terrae, Proteus vulgaris (2), Pseudomonas koreensis, Pseudomonas moraviensis, Pseudomonas prosekii y Serratia marcescens (2). The culture-independent analysis detected the Proteobacteria and Bacteroidetes phylum as predominant in water and soil contaminated with hydrocarbons; Likewise, the taxonomic allocation at the family level highlighted the groups Flavobacteriaceae, Moraxellaceae, Verrucomicrobia and Acetobacteraceae as the most abundant, in addition to the genera Acinetobacter, Flavobacterium and Geobacter present in both samples. In this way, the main groups involved in the degradation of petroleum hydrocarbons were determined using culture-dependent and independent techniques.
El uso del petróleo y sus derivados se ha visto intensificado por la alta demanda energética actual; esto ha traído consigo el incremento de accidentes ambientales como los derrames de combustibles que afectan negativamente los ecosistemas. En estos ambientes existen microrganismos capaces de sobrevivir a dichas condiciones y utilizar los hidrocarburos de petróleo como fuente de carbono y energía; siendo propuestos en la biorremediación con un enfoque ecoamigable y costo-efectivo. En este trabajo se aislaron e identificaron cepas bacterianas con potencial biorremediador en medios de cultivo suplementados con petróleo, a partir de una zona contaminada por derrame de petróleo en la Amazonía peruana; también se realizó la caracterización de la comunidad bacteriana por análisis independiente de cultivo mediante secuenciamiento de próxima generación dirigido al gen ARNr 16S. Las cepas bacterianas aisladas se identificaron como: Acinetobacter rudis, Enterobacter cloacae, Klebsiella oxytoca, Morganella morganii, Proteus hauseri, Proteus terrae, Proteus vulgaris (2), Pseudomonas koreensis, Pseudomonas moraviensis, Pseudomonas prosekii y Serratia marcescens (2). En el análisis independiente de cultivo detectaron los filos Proteobacteria y Bacteroidetes como predominantes en agua y suelo contaminados con hidrocarburos; así mismo, la asignación taxonómica a nivel de familia destacó los grupos Flavobacteriaceae, Moraxellaceae, Verrucomicrobia y Acetobacteraceae como más abundantes, además de los géneros Acinetobacter, Flavobacterium y Geobacter presentes en ambas muestras. De esta manera, se determinaron los principales grupos implicados en la degradación de hidrocarburos haciendo uso de técnicas dependientes e independientes de cultivo.