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tesis de grado
Publicado 2024
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El alineamiento de secuencias figura como una de las prácticas predominantes en la Bioinformática. Se crearon métodos basados en alineación como BLAST, BLAST+, FAS- TA, HMMER, RapSearch, que se encargaron inicialmente de esta tarea. Sin embargo, todos estos métodos son lentos en el tiempo de procesamiento además, de no ser útiles para los genomas, ya que analizar miles de estos resulta excesivamente costoso y caro para su capacidad. Esto lleva a la existencia y creación de múltiples métodos libres de alineación para la comparación de secuencias. En el presente trabajo, se examinan los métodos Kameris y Castor, siendo estos libres de alineación para la clasificación del genoma de ADN. Estos métodos son comparados con las reconocidas CNNs Resnet-50, Inception, VGG19, VGG16. Adicionalmente, se lleva a cabo una comparación con métodos descriptores de imágenes que son LBP, ...