Identificación molecular de virus ARN que afectan cultivares de tomate (Solanum lycopersicum) en la costa del Perú

• Autor: Rodriguez Grados, Pedro Manuel
• Formato: tesis de grado
• Fecha de Publicación: 2023
• Institución: Universidad Nacional José Faustino Sánchez Carrión
• Repositorio: UNJFSC-Institucional
• Lenguaje: español
• OAI Identifier: oai:repositorio.unjfsc.edu.pe:20.500.14067/7465
• Enlace del recurso: http://hdl.handle.net/20.500.14067/7465
• Nivel de acceso: acceso abierto
• Materia: PCR; cDNA; Cebadores; Virus ARN; https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.00

Objetivo: Identificar molecularmente los virus ARN que afectan a cultivares de tomate en la costa del Perú. Materiales y métodos: Se recogieron hojas de plantaciones de tomate que presentaron sintomatología por infección viral, las hojas colectadas se les realizó una molienda con nitrógeno líquido para lograr extraer el ARN utilizando un kit comercial y se le realizó una digestión con la enzima DNAsa para tener una muestra pura de ARN sin rasgos de ADN. Se realizó para sintetizar el ADN complementario, luego de se empleó una PCR, determinando sus condiciones óptimas de amplificación, los resultados se observaron en una electroforesis en gel de agarosa, las muestras que fueron positivas para los patógenos por PCR, se enviaron a secuenciar al extranjero. Las muestras de los virus secuenciados se alinearon con otras secuencias de virus reportados, que se descargaron del GenBank y se realizó un análisis filogenético. Resultados: Los resultados encontrados nos mostraron la indicencia de 2 virus en particular encontrados el Peru Tomato Mosaic Virus (PToMV) en 50% de las zonas muestreadas en la costa del Perú, así como el Tomato Brown Rugose Fruit Virus (ToBRFV) en un 83.3% de las zonas muestreadas y en un del 88.9% de todas las variedades analizadas. Además, los análisis genómicos obtuvieron un porcentaje superior al 95% de identidad de las muestras en estudio con las reportadas en el GenBank del NCBI. ¿Conclusiones: Se identificaron molecularmente dos virus ARN fitopatógenos que afectaron a cultivares de tomate en la costa del Perú y una alta similitud de los mismos con las cepas reportadas.